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Hortic Res 专刊发布会 |园艺作物T2T基因组

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『点击免费订阅《园艺研究》电子刊』

 

 
 

专刊发布会

 
 


 

 

时间:2022年1月14日 下午3:00

流程:

 
 
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1 介绍专刊信息

刊载范围,青睐的文章等。

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2 前沿成果报告

(1)主题:园艺作物T2T参考基因组

(2)报告人简介:

周永锋,研究员。2014年博士毕业于芬兰奥卢大学(University of Oulu),2014-2020年期间先后在奥卢大学与美国加州大学(University of California)从事博士后研究。主要从事作物群体基因组学与遗传育种工作,开展了水稻、葡萄等作物的驯化群体基因组学研究,揭示了作物的驯化成本,以及重要农艺性状相关的适应性变异、有害变异与结构变异。到目前为止,共发表SCI论文20多篇,其中以通讯或第一作者或通讯作者在Nature PlantsPNAS、 Molecular Biology and Evolution等杂志发表SCI论文12篇。

 

3 专刊交流答疑

如果您有任何专刊相关的问题,请点击下方链接提交问题,我们会汇总给专刊客座编辑并在发布会“第三环节”上进行解答,欢迎大家积极提问。

 

http://journals.mikecrm.com/IA8yI8E

 

 
 
 

 

 

 
 

T2T基因组简介

 
 

 

T2T(Telomere-to-Telomere)基因组是通过多种测序平台、高深度测序,组装获得的gap-free或近gap-free高质量基因组。该技术解决了着丝粒或高重复区域的组装难题,使得染色体的连续性和完整性大幅提高,为后续对于着丝粒和高重复区域进行深入研究提供基础。随着长读长测序技术的更新和发展,“ONT超长+HiFi”已实现人类的X染色体和8号染色体T2T组装。ONT与HiFi,二者强强联合,为着丝粒和重复区段组装提供了强有力的新策略。

 

 
 

贝纳基因

 
 

 

贝纳基因生产研发部通过改良、优化动植物样品提取流程,目前已完成多类动、植物样本的ONT超长建库测序,具有丰富的动、植物组织超长DNA提取和ONT Ultra-long建库测序项目经验。最新案例某单子叶植物 ONT Ultra-long测序,不切胶、不富集片段,单张芯片reads N50大于100kb的数据量为22.6Gb,长度大于100kb的reads占总数据量31.5%,为T2T基因组研究提供强大基础。

 
 
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