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【CGM在线沙龙预告】CGM第254期:结构变异和基因树不一致性在灵长类演化和疾病中的机制

编者荐语:

 

由贝纳基因赞助的CGM沙龙,此次为您带来上海交通大学Bio-X研究院毛亚飞博士的分享。


以下文章来源于CGM基因组沙龙 ,作者Li Fangping

CGM将于北京时间 2022年06月15日 (星期三) 8.PM(美国中部时间06月15日 7.AM;欧中时间0615 2.PM举办254期在线沙龙活动。

 

本期活动,我们邀请到了来自上海交通大学Bio-X研究院毛亚飞博士带来题为“结构变异和基因树不一致性在灵长类演化和疾病中的机制”的分享。

 

腾讯会议ID: 462-849-390

腾讯会议链接:https://meeting.tencent.com/dm/tKkYACE803qD

 

嘉宾简介

 

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毛亚飞本科2014年毕业于南京大学生命科学学院。后于日本冲绳科学技术大学院大学攻读博士学位,师从Noriyuki Satoh教授(日本紫绶褒章获得者)和Evan Economo教授(现任哈佛研究员)学习基因重复和基因树不一致性在演化中的机制。毕业后于2019年加入华盛顿大学Evan Eichler教授(美国科学院和医学院院士)实验室进行博士后研究,主攻结构变异在适应性演化和人类疾病中的生物学机制。主要研究成果包括以第一作者或通讯作者发表在Nature、Current Biology、iSceince、Molecular Ecology Resources等杂志上,受到同行的广泛关注和引用。目前当人eLife青年审稿库成员,即将担任BMC Biology编委。

内容摘要

结构变异与不完全谱系分拣在灵长类演化过程中扮演着重要的作用,通常和疾病息息相关。然而,对于结构变异同不完全谱系分拣在灵长类的研究却仍然不足。因此,本研究通过比较不同灵长类基因组发现了百万个未发现的结构变异。部分结构变异会导致基因丢失,基因结构改变或者基因重复。这些结构变解释了灵长类演化过程中的适应性演化和人类疾病的产生。除此之外,本研究还通过构建完整的不完全谱系分拣图谱发现人类5.1%的基因组和黑猩猩或倭黑猩猩有着更近的遗传关系,其中21%的位点具有聚集现象并受到自然选择的压力。进一步对猿类进化的研究发现人类近50%的基因组受到不完全谱系分拣的作用。该研究充分的展示了结构变异同不完全谱系分拣在灵长类进化过程中扮演的重要作用, 为了解答人类为什么是人类这一问题提供了遗传演化的视角。

 

关键词:

Structural variation, Gene Tree discordance, primates, disease

 

参考文献:

Mao, Yafei, et al. "A high-quality bonobo genome refines the analysis of hominid evolution." Nature 594.7861 (2021): 77-81.

Mao, Yafei, Evan P. Economo, and Noriyuki Satoh. "Theroles of introgression and climate change in the rise to dominance of Acroporacorals." Current Biology 28.21 (2018): 3373-3382.

Logsdon, Glennis A., etal. "The structure, function and evolution of a complete human chromosome 8." Nature 593.7857 (2021): 101-107.

 

参加方式

 

北京时间: 2022 年 06 月 15 日(星期三)8:00 PM

美中时间: 2022 年 06 月 15 日(星期二)6:00 AM

 

参与平台:Zoom及Youbube直播(关注:CGMonline)

 

加入腾讯会议:https://meeting.tencent.com/dm/tKkYACE803qD

腾讯会议ID:462-849-390

 

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华人基因组学在线沙龙 (CGM),由几位在北美从事基因组学研究的青年华人学者于 2017 年 1 月份发起。旨在增进从事基因组学研究的华人之间的交流、学习和合作。欢迎从事分子生物学、遗传学、基因组学、生物信息学、生物统计学、进化生物学相关领域的华人同学(包括本、硕、博和博后)和老师参与。论坛每周一次,每次邀请一到两位学者就自己的研究课题进行学术汇报。汇报主要以中文的形式网络直播。

 


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