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喜讯 | 贝纳基因再次引进Nanopore PromethION 48测序平台!

 

2022年6月18日,Nanopore PromethION-48(以下简称P48)正式入驻贝纳基因武汉总部。由贝纳基因总经理陈虎、生产部总监田朝阳以及项目管理部负责人夏叶等人为主导举办“开箱仪式”!截至目前,这是我司引进的第4台Nanopore PromethION测序仪,也是国内拥有Nanopore仪器最大的三代测序供应商。

 

首先,由总经理陈虎携专业工作人员将p48引入实验室

 





 



P48仪器进入实验室

 
 



总经理陈虎及其他工作成员等待开箱

 

项目管理部负责人夏叶开箱,并检查仪器。
 

P48仪器拆箱及检验

 

01

P48技术优势

PromethION P48是Oxford Nanopore的最高通量测序装置,支持分别或同时运行多至48张测序芯片。P48在产量上不仅能与市场上最高通量的传统测序仪相匹敌,同时还具有实时、长读长、直接测序等特点,能直接分析DNA、RNA分子和甲基化修饰。P48仪器体积小巧,只需一张普通的实验桌便可以放下。迄今最高通量:PromethION测序仪突破7Tb记录。

 

02

引进Nanopore PromethION 测序平台时间线

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2018年,正式推出阿高通量测序设备PromethION,贝纳基因成为第一个引进PromethION测序平台的三代测序公司;

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2019年,PromethION商用版PromethION24(简称P24)和PromethION48(简称P48)正式推出,贝纳基因分别引进P24和P48一台,是国内拥有PromethION测序平台最多的公司;

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2022年,贝纳基因再次引进P48;

 

03

贝纳基因 Nanopore 测序的优势

贝纳基因做为国内首批引进 Nanopore PromethION 的测序平台,拥有多年的高通量测序,三代测序和 Nanopore 测序,以及生物信息分析经验,在Nature 和 Science 系列杂志发表多篇学术论文。

 

贝纳基因使用 Nanopore 平台完成数千份细菌基因组、宏基因组测序和数据分析;完成数千份全长转录组和 Direct 转录组测序分析。提出和推动基于Nanopore 测序的万种微生物基因组完成图计划和10万个人的 Nanopore 宏基因组计划。

 

贝纳基因使用 Nanopore 平台完成全球第一个大型复杂植物基因组菊花基因组的组装和后续分析工作。提出和推动千种本草基因组计划,并构建药用植物基因组数据库,推动药材研究的发展。

 

04

Nanopore 测序技术简介

Nanopore是基于纳米孔的单分子实时电信号测序技术。其技术原理是DNA 双链在马达蛋白的带领下与镶嵌在生物膜上的纳米孔蛋白结合并解螺旋,在生物膜两侧电压差的作用下,DNA 双链以一定的速率通过纳米孔通道蛋白,由于DNA 双链上不同碱基化学性质存在差异,所以当单个碱基或DNA 分子通过纳米孔通道时,会引起不同电学信号的变化。通过对这些信号进行检测及对应,即可计算获得相应碱基的类型,完成序列的实时测定。

 

05

Nanopore 测序特点

  • 体积小。

  • 读长长,比 PacBio测序的还要长,平均读长能够达到几十到上百 Kb,最长读长能达到2 Mb以上。

  • 能直接读取出甲基化的胞嘧啶,不用像二代测序那样需要事先对基因组进行 bisulfite 处理。

  • 数据实时读取,并且起始DNA在测序过程中不被破坏。

  • 成本低,比 PacBio 测序便宜。

 

 

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