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近年药用植物基因组文章大盘点


传统医学和药用植物在全球范围内被用于治疗各类疾病已有几千年的历史,随着测序技术的发展,针对有重大经济价值的药用植物进行全基因组测序及功能基因组研究,能够推动药用植物资源化发展。

 

贝纳基因构建了首个千种药用植物基因组数据库(http://www.herbgenome.com/),该数据库目前收录了近百种药用植物基因组数据,将次生代谢物探究与基因组分析相结合,数据库中含有多个在线分析功能,该数据库将“代谢物-基因-基因组”相关研究完美结合,为药用植物研究者提供一站式的药用植物基因分析平台,为科研学者提供极大便利。

 

小编汇总了近年来发表的近百余篇药用植物基因组文章,对近年发表的药用植物基因组文章进行统计,发现自2014年以来,每年都会有近10篇药用植物基因组文章发表,在2021年,药用植物基因组文章发表数量最多,预计2022年会持续增长。

 

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图1 近年发表的药用植物基因组文章数量统计

 

同时,小编对所有文章的影响因子分布进行统计,有不少药用植物的基因组发表在Nature Biotechnology、Nature、Science等顶级杂志。小编将对不同IF分段文章发表数进行详解,为各位读者在药用植物基因组方向的研究助力。

 

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图2 药用植物基因组文章IF分布

 

小编汇总了自2012年以来发表的药用植物基因组的期刊,并对文章篇数进行分段统计。从统计结果可看出,大部分药用植物基因组文章都能发到较好的杂志,IF>5的文章篇数占90%以上,其中有约80%的药用植物基因组在5<IF<16的杂志进行发表。

 

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图3 5<IF<10 药用植物基因组发表期刊统计

 

详细统计了5<IF<10中发布药用植物基因组的杂志,从统计结果中可看出,Plant Journal(IF=6.417)杂志发表的药用植物基因组最多(15篇),此外,Plant Biotechnology journal(IF=9.803)、Horticulture Research(IF=6.793)和GigaScience(IF=6.524)分别发布的药用植物基因组文章在5篇以上。

 

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图4 10<IF<16药用植物基因组发表期刊统计

 

小编也详细统计了10<IF<16中发布药用植物基因组的杂志,从统计结果中可看出,Molecular Plant(IF=13.164)杂志发表的药用植物基因组文章高达19篇,Nature Plants(IF=15.793)和Nature Communications(IF=14.919)发布的药用植物基因组文章在10篇左右。

 

总体而言,一个高质量的参考基因组是基础,冲刺顶刊取决于最终“生物学问题”的解析。对于药用植物基因组来说,最重要的就是其有效活性成分的相关研究,“基因组+转录组+代谢组”的多组学研究思路,是药用植物基因组的研究及药用有效活性成分解析的核心,同时,物种的知名度与研究领域的热度也会助力文章的发表。

 

2022年已经到来,小编将整理汇总的百余篇“药用植物基因组文献”打包给各位读者,Excel中详细统计了物种组装的基因组大小、基因组测序平台、发表期刊并附文章链接,希望对读者在药用植物基因组领域的研究提供帮助。

 

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