研究结果
1.在水稻中,鉴定了12,037条circRNA,在拟南芥中鉴定了6,012条circRNA。这些circRNA主要来源于编码区。
2.PCR验证了水稻中56%(10/18)预测的circRNA。
3.通过对circRNA来源基因在其他物种中搜索同源基因,发现水稻和拟南芥有700个circRNA来源基因在其他物种存在同源基因。没有发现circRNA的内含子区域存在保守的motif。
4.circRNA的内含子长度大于线性基因,具有更少的重复序列和反向互补序列。
5.植物的circRNA具有不同的表达模式,在磷充足和磷饥饿条件下,有27个circRNA差异表达。一些circRNA基因的表达模式和它们的来源基因显著相关。