2025年4月17日，生信大神李恒教授团队发表最新研究成果“Efficient near telomere-to-telomere assembly of Nanopore Simplex reads”。该研究开发了一种高效从头组装算法hifiasm（ONT），首次仅用高准确性ONT-sup数据（普通长度或超长）即实现端粒到端粒（T2T）基因组近完成图组装。

贝纳基因首批测试数据发现，ONT测序通过SUP basecall，获得QV值大于20（准确性大于99%）的高准确性的SAR (Super Accuracy Reads) 数据，结合使用hifiasm（ONT）软件，组装效果得到大幅度提升！！

1. 简单基因组普通长度ONT only（SUP）测序，使用hifiasm（ONT），直接达到T2T水平

2. 与HIFI组装相比，ONT only（SUP）测序，使用hifiasm（ONT），组装连续性更好

相关数据在李恒团队hifiasm（ONT）实现ONT only近T2T基因组组装 — 贝纳基因首发测试数据验证进行了报道。

本次，我们提供了第二批测试数据

根据以上测序数据，我们推出以下测序方案

1. 基于ONT only——T2T组装策略

2. 基于ONT only——普通基因组组装策略



前情回顾

2024年5月，贝纳基因结合ONT SQK-LSK114试剂及basecaller - V5.0.0 sup模型，在ONT测序质量值上取得重大突破（人源样本，中位值达Q28，准确性达到99.84%），获得高准确性ONT SAR数据。SAR的高准确性，是ONT only实现T2T组装的保证！

ONT测序质量值重大突破 | 中位值达Q28（准确性达到99.84%）

注：原有高精度Hac basecalling质控模型，hac-v4.3.0，单链读取Q20（准确性：99%）；hac-v5.0.0，单链读取Q21（准确性：99.2%）；超高精度Sup basecalling质控模型，sup-v4.3.0，单链读取Q24（准确性：99.60%）；sup-v5.0.0，达到单链读取Q28（准确性：99.84%）

后续测序，我们还会考察不同深度的ONT only组装效果；不同长度的ONT only组装效果；ONT only与HIFI数据对复杂高重复区域的处理能力等等，大家尽情期待！！