贝纳基因10x和C4双平台护航,一站式解锁科研超清视野!
单细胞测序技术正以"细胞级分辨率"掀起生命科学研究的浪潮!从肿瘤异质性解析到发育图谱构建,从疾病机制挖掘到药物靶点筛选,高分文章的背后总少不了单细胞测序的身影。
以“Single cell RNA sequencing”为关键词的检索结果
贝纳基因推出单细胞测序全流程解决方案,双平台技术+专业解离经验+个性化数据挖掘,助您轻松攀登科研高峰!
实验双平台,灵活选择

单细胞上机建库实景

贝纳实验员上门进行单细胞实验
贝纳基因单细胞服务全流程

1、需求沟通:技术人员一对一评估样本类型/数量/研究目标;
2、方案设计:针对研究目的、样本情况、预期发表文章等设计实验方案;
3、样本解离:上门/邮寄样本解离&建库,微信群&邮件反馈关键步骤结果;
4、生信交付:标准化报告+个性化深度挖掘。
单细胞数据挖掘思路
单细胞测序不仅仅前期实验质量要高,后续分析也是非常重要的。我们根据多篇单细胞测序文章,整理出常见单细胞数据挖掘思路“三步走”。
第一步:构建细胞图谱,打好数据基础
先对单细胞数据做数据质控,过滤低质量细胞、双细胞等,再通过细胞聚类挖掘不同细胞类群,最后结合自动化注释与人工注释校正,完成细胞类型注释,构建清晰细胞图谱,为后续分析定基调。
第二步:锁定关键细胞亚群,聚焦研究重点
从多维度挖掘关键细胞亚群:借助细胞动态分析,看组间细胞类型比例、差异基因变化;用细胞命运分析,做拟时序分析,找时序变化相关的开关基因,分析细胞分化轨迹,或者进行RNA速度分析;通过细胞通讯分析(如CellPhoneDB、CellChat等工具),解析细胞间信号交流;还能结合单细胞联合空间分析(Cell2location、SPOTlight等方法),关联空间位置信息,精准锁定关键亚群。
第三步:解析调控机制,挖掘生物学意义
找到目标亚群后,深入解析调控:用GO/KEGG、GSEA等做功能富集分析,明确功能方向;借SCENIC等开展转录因子调控网络分析,挖掘关键调控因子;还能结合TCGA、GEO数据库等公共数据库数据,进行临床相关性分析,让研究从“找现象”到“探本质”。

无论是基础科研解析细胞异质性,还是临床研究挖掘肿瘤免疫、疾病机制,这套单细胞测序数据挖掘思路,都能帮您精准解码数据,挖掘细胞层面的生物学奥秘。下面是贝纳基因基础分析和个性化分析内容展示:

单细胞测序生信分析流程图
部分基础分析内容展示

部分个性化分析内容展示

若您近期想要开展单细胞转录组测序,欢迎与我们联系,免费获取单细胞转录组实验方案设计!
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