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前沿讲座 | 李恒教授领衔开发!Hifiasm(ONT) 灵魂人物程昊宇揭秘 Nanopore T2T 高质量组装

格物致知·创新前沿论坛 | ONT-only T2T组装的挑战与思考



在高质量基因组组装日益迈向端到端(T2T)时代,如何仅依赖纳米孔测序(ONT-only)完成T2T基因组组装,成为当下组装算法与实践的重要课题。

本期“格物致知·创新前沿论坛”将于 2025年7月2日(周三)20:20 准时上线,贝纳基因诚邀耶鲁大学生物医学信息与数据科学系程昊宇教授主讲,结合其长期从事三代组装工具开发的经历,分享对ONT-only策略与高质量组装路径的深入理解与经验总结。


🔈本次讲座由知名生信专家李恒老师亲自推荐,欢迎关注组装技术前沿的各位老师与同仁参与交流!




讲座亮点:从工具开发者视角解读三代组装路径



程昊宇教授是 Hifiasm 组装软件相关文章的第一作者,在三代测序数据结构建图、纠错优化、杂合处理等方面具有丰富的算法开发与实践经验。他曾在李恒老师团队担任博士后,长期参与 Hifiasm 核心模块的架构设计与持续迭代,是该工具发展的关键贡献者之一。


本次讲座将从工具开发与实际应用的双重视角出发,带领听众深入了解ONT-only组装中的关键技术路径与策略考量,为三代数据研究提供系统性的思路参考。




技术落地与方法思考兼具,适合关注三代测序及T2T基因组研究的你



目前程教授在耶鲁大学继续从事基因组组装算法、三代测序数据分析及相关交叉课题的研究,并致力于推动相关方法在多种复杂基因组研究中的拓展与优化。


本次讲座聚焦高质量组装、三代测序数据处理、ONT-only策略等热点议题,内容专业、信息浓度高,适合对组装算法、生物信息学工具、三代平台数据分析感兴趣的听众参与。诚邀您的准时加入,共话基因组研究新趋势!

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报告内容

本报告将介绍最新发布的组装算法 Hifiasm (ONT),这是首个可基于标准 Nanopore Simplex 数据实现近端粒到端粒(T2T)组装的工具,突破了对 HiFi 数据和超长测序数据的依赖。与现有方法相比,Hifiasm (ONT) 显著降低了计算资源需求,并可在相同数据基础上组装出更多完整染色体,首次真正实现了基于 ONT-only 数据的高质量 T2T 组装。该工具的开发大幅拓展了 T2T 组装在常规样本中的应用边界,有望加速 T2T 组装在日常研究实践中的广泛应用。


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讲师简介

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格物致知

“格物致知”创新前沿论坛是由贝纳基因主办,每期邀请行业内知名科学家,进行前沿成果报告和回答问题两部分,更侧重于与听众们进行科学相关问题的探讨!聚焦基因组学和多组学研究,内容含涉动植物和微生物基因组学、表观组遗传学、蛋白质组学和代谢组学及其他相关学科。 



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