细菌DRS

细菌直接RNA测序（DRS）：基于Nanopore测序平台，能够直接读取完整的天然RNA分子，无需进行逆转录或PCR扩增，可同步完成多种RNA类型的检测，并直接鉴定单碱基水平的：m6A、m5C、假尿苷、肌苷和2-O-甲基化等多种RNA修饰位点，同时精准解析转录本及操纵子结构。

细菌DRS技术的实验原理

对提取的细菌总RNA进行rRNA去除后，对剩余RNA进行直接RNA建库测序，在获得转录本和操纵子结构的同时，获取RNA分子上的多种修饰信息。

细菌DRS建库流程图

细菌DRS技术优势

1、直接读取全长转录本结构，避免拼接偏差

细菌DRS能直接读取完整的全长转录本,精准界定5'-和3'-UTR的边界与长度,还原最真实的转录本结构

同一基因组区域能产生长度、起始终止位点不同的多个转录本

2、直接检测RNA修饰，无需抗体或酶处理

细菌DRS能够同时鉴定单分子单碱基水平的:m6A、m5C、假尿苷、肌苷和2-O-甲基化等多种RNA修饰位点。

一次性鉴定多种RNA修饰类型

3、解析操纵子精细结构，揭示复杂调控网络

细菌DRS凭借其长读长优势，能够直接绘制出多顺反子操纵子的完整结构，清晰揭示内部启动子、终止子以及共转录等精细结构。

分析操纵子精确结构

4.同时分析多类型RNA，一站式解析全转录组

一次细菌DRS实验，即可同步获取mRNA、rRNA、tRNA、ncRNA等RNA类型的全长序列及其修饰信息，为您提供一份全面、立体的细菌基因表达及修饰图谱。

鉴定多种RNA类型

参考文献

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GuoZ,etal.Enhanced detection ofRNAmodificationsinEscherichia coliutilizing directRNA sequencing.CellRepMethods.2025

LuTan,etal.Analysisofbacterialtranscriptome andepitranscriptomeusing nanopore directRNAsequencing,NucleicAcidsResearch.2024.

SebastianRiquelme-Barrios,etal.DirectRNAsequencingoftheEscherichiacoliepitranscriptomeuncoversalterationsunderheatstress

NucleicAcidsResearch.2025