Q1:蛋白组一般建议做多少个生物学重复?
原则上是生物学重复越多越好,排除个体差异,筛选的差异蛋白更准确,验证成功率更高。考虑到经费、统计分析需要及后续编辑可能会质疑的情况,临床样本建议每组 5 个重复以上,其他来源样本每组至少三重复,以便计算显著性意义的 p 值。
Q2:什么样本能做蛋白组学检测?大概测到多少的蛋白种类?
原则上只要能提取到蛋白,就可以做蛋白组检测。样本测到的蛋白种类跟数据库和样本本身蛋白浓度有关,一般数据库越大,可以鉴定到的蛋白质数量越多。也与样本的类型有关,通常,组织细胞相比于体液样本,能够鉴定到更多的蛋白。
Q3:我的样本不知道有没有降解,量够不够?
常规蛋白组检测项目,我们会进行蛋白浓度的测定,确定蛋白量是否够用于后续的检测。同时也会进行 SDS-PAGE 跑胶查看蛋白是否有降解,条带是否明显,如果蛋白量不够或者胶条有异常,我们会及时反馈客户并沟通解决方法。