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一个物种一个家
基因组数据库相当于一个物种的官网,关心该物种的科学家可以通过访问网站了解物种信息、科研进展、下载基因组数据、进行blast等简单分析。基因组数据库最核心的模块是基因组浏览器,可以可视化查看基因结构、变异位点、基因表达等信息。
为什么要搭建基因组数据库
1
方便共享数据
基因组数据库可以汇集一个物种的所有基因组信息,收集和共享数据;
2
可视化分析
数据
基因组浏览器可以对基因组碱基组成、基因结构、SNP等变异信息、基因表达量等进行可视化的生动展示
3
提威望
提高您在该领域的知名度和权威性
4
发文章
提高您在该领基因组数据库数据积累起来之后可以独立发文章域的知名度和权威性
标准基因组数据库(单个物种)
几乎所有已测序国外机构测序的物种都建立了独立的基因组数据库,
比如:水稻、拟南芥、果蝇、小鼠、玉米、家蚕、可可等,还有近期发表的猕猴桃、无油樟。
我们推出的标准基因组数据库包含以下模块
:
1.物种信息:介绍该物种的进化地位、特性、科研进展等
2.基因组信息:介绍基因组大小、组装结果、注释结果、图谱、共线性分析等
3.FTP服务器:方便下载基因组相关数据
4.可视化Blast服务器:方便从基因组、CDS、蛋白序列中提取关心的序。
5.基因组浏览器:基于Gbrowse或Jbrowse的基因组浏览器,可视化查看每一条序列的碱基组成、变异信息(支持重测序结果bam、vcf格式)每一条基因的结构、表达丰度(支持转录组数据)
同科(属)、同类物种基因组数据库
同一个科属的物种为了比较基因组学研究的方便,也建立了数据库。比如:蔷薇科、柑橘属。
相关物种为了功能基因组学的研究方便,建立了基因组数据库。比如:硬木、豆类、作物。
除了为每个物种提供标准数据库的功能外,多个物种数据库还可以提供比较基因组的分析。
功能多样 价格实惠
标准数据库仅需5万/个
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