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全长lncRNA测序是指无需对去除rRNA后的RNA进行打断，直接获取逆转录cDNA的5’到3’全长序列。不依赖于Poly（A）尾富集，同时对含有Poly（A）尾和不含有Poly（A）尾的IncRNA转录本进行鉴定和定量，并系统全面的进行可变剪切分析。
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技术流程
应用方向
十字花科植物基因间区长链非编码RNA的鉴定与功能注释成果（The Plant Cell，IF=12.085）
综合分析了2018年12月之前NCBI上所有的拟南芥、亚麻荠、芜菁和盐芥的RNA-seq数据，超过16,000个RNA-seq数据。对拟南芥、亚麻荠、芜菁和盐芥（10天的幼苗、4周成熟的莲座状叶以及开放的花），进行Illumina lncRNA测序和ONT全长转录组测序。
分别从拟南芥、芜菁、亚麻荠和盐芥中鉴定出9306、58155、13163和20744个高置信lincRNA(HC-lincRNA)。
通过翻译组数据（Ribo-seq）和蛋白质质谱（MS）数据鉴定lincRNA中的微小阅读框（sORFs）和蛋白产物，共鉴定到1172个lincRNA 的TPM大于0.1，120个在Ribo-seq数据中检出，38个在MS数据中检出，并且编码的氨基酸数量在3到136个之间。此外发现，转录本与sORF长度无相关性，然而Araport11数据库的HC-lincRNA比Evolinc衍生的lincRNA含有更长的sORF。
参考文献
Kyle Palos, et al., Identification and functional annotation of long intergenic non-coding RNAs in Brassicaceae, The Plant Cell, 2022.
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