NC解读|纳米孔Direct RNA测序揭示TENT5介导mRNA多聚腺苷酸化调控生殖细胞形成机制
英文标题:TENT5-mediated polyadenylation of mRNAs encoding secreted proteins is essential for gametogenesis in mice
发表时间:2024.5
发表期刊:Nature Communications
IF:14.9
通讯作者:Andrzej Dziembowski(International Institute of Molecular and Cell Biology, Warsaw, Poland)
研究介绍
TENT5介导的多聚腺苷酸化过程对小鼠生殖细胞的形成至关重要。本研究首次揭示了TENT5家族中的四种非典型聚腺苷酸聚合酶(TENT5A、TENT5B、TENT5C和TENT5D)在小鼠生殖细胞发育过程中发挥着不可或缺的作用。特别是,TENT5B和TENT5C在卵子形成中具有重要且部分冗余的功能,而TENT5C和TENT5D则参与了精子形成的不同阶段。通过纳米孔Direct RNA测序技术,鉴定出TENT5在卵巢和睾丸中的靶向mRNA,其可以编码多种分泌蛋白,参与调控生殖细胞的形成。研究结果表明TENT5在生殖细胞中可以对特定mRNA进行聚腺苷酸化,从而调控其稳定性和翻译效率,为理解生殖细胞中mRNA的复杂调控网络提供了新的视角。
研究结果
1. TENT5家族poly(A)聚合酶影响生殖细胞形成
为了探究TENT5家族的细胞质poly(A)聚合酶在生殖中的作用,作者构建了一系列基因敲除小鼠模型。单独敲除TENT5家族每个成员对小鼠的发育和异型交配的出生比例没有影响(图1A),而会导致雄性和雌性小鼠出现部分或完全不育(图1B)。尽管Tent5a 的缺失与部分不育相关,但是雌雄性生殖细胞的形态和结构正常,其中卵巢能够产生健康的卵母细胞,并且分离的GV期卵母细胞能够在体外成熟至减数分裂II中期(图1C)。由此说明,Tent5c和Tent5d对精子形成至关重要,而Tent5b和Tent5c在卵子形成中发挥关键但冗余的作用,Tent5a并不与生殖细胞形成过程直接相关。
2. 缺少Tent5b和Tent5c导致卵子形成发生早期停滞和退化
Tent5b/c基因双敲除会导致雌性不育,而仅有Tent5b或Tent5c足以维持正常的生育能力,表明这两个基因在功能上存在冗余。相应地可以在Tent5c-GFP和Tent5b-GFP敲入雌性小鼠中观察到这两个基因在卵母细胞的GV阶段有高度表达(图2A)。
对不同周龄的敲除小鼠进行解剖染色及细胞计数可知Tent5b/c双敲除的卵母细胞出现与成年双敲除雌性相似的早期退化迹象(图2B、C)。切片染色证实Tent5b/c双敲除雌性小鼠没有成熟卵泡和黄体的存在,以及卵泡直径显著减小表明在早期窦状卵泡阶段的卵泡发育停滞(图2D、E)。此外,TUNEL试验也显示卵母细胞内部和周围颗粒细胞均出现明显凋亡(图2F)。以上从形态、生理及细胞水平综合说明Tent5b/c缺失会导致卵子形成的早期停滞和退化。
图1:TENT5家族poly(A)聚合酶影响生殖细胞形成
图2:缺少Tent5b和Tent5c导致卵子形成发生早期停滞和退化
3. Tent5b C端GFP蛋白的负面效应
在Tent5b编码蛋白TENT5B的C端添加GFP蛋白(TENT5B-GFP) 导致雌性不育,而在TENT5B的N端(GFP-TENT5B)或者TENT5C的C端(TENT5C-GFP)添加GFP蛋白,则无任何异常,并且TENT5B-GFP中GFP融合蛋白表达量明显较高(图3A、B)。通过不同的组合交配发现只有雌性携带C端GFP标签时,其生育能力显著降低,尤其是在纯合子中,这一影响更为明显(图3C)。进一步观察显示,尽管TENT5B-GFP雌性的卵细胞仍然可以存活并能进入到第二次减数分裂的MII阶段,但是与野生型的染色体聚集不同,杂合子中的染色体表现出明显分离(图3D、E)。MII阶段免疫荧光染色结果显示,约有1/4的卵细胞存在一定程度的染色体结构破坏,以及细胞质中存在大量看似空洞或液泡化的结构,这可能与纺锤体和染色体排列紊乱有关(图3F、G)。
图3:TENT5B C端GFP蛋白的显性效应
4. TENT5家族参与卵母细胞mRNA的多聚腺苷酸化
通过对野生型、Tent5 b/c双敲除、以及30日龄携带TENT5B-GFP的纯合和杂合雌性小鼠细胞进行Direct RNA测序及polyA长度分析,结果表明,双敲除对卵巢中整体mRNA的 poly(A)尾巴长度分布影响不大(图4A、B)。然而,polyA长度差异分析显示polyA显著缩短的mRNA可以编码参与卵子发生的关键蛋白,比如透明带糖蛋白3(ZP3)和生长分化因子3(GDF9),这一结果也在PCR poly(A)检测中得到验证(图4C、D)。对5周龄野生型和Tent5b/c 双敲除雌性卵母细胞进行二代转录组测序和分析,筛选出在卵母细胞高表达的mRNA,结合DRS数据分析发现Tent5b/c 双敲除中有37个mRNA的ployA尾缩短,而TENT5B-GFP中有48个mRNA的ployA延长,并且其中有20个属于共有的mRNA,进一步分析显著变化的mRNA的polyA长度分布,表明双敲除和TENT5B-GFP敲入导致相反效果(图4E~G)。免疫荧光染色结果显示在卵泡发育后期,GDF9的水平显著降低,而ZP3蛋白的水平也有所减少,这与卵泡在早期发育停滞的表型相符(图4H)。以上结果表明,Tent5b和Tent5c参与卵母细胞mRNA的多聚腺苷酸化。
图4:TENT5家族参与卵母细胞mRNA的多聚腺苷酸化
5. Tent5c和Tent5d影响精子形成过程
Tent5c和Tent5d敲除均会导致雄性不育。免疫荧光染色结果显示,Tent5c在3周和8周龄雄性生精小管腔附近精子细胞中表达较高,而Tent5d在年轻雄性睾丸组织早期减数分裂阶段表达较少,并在成年雄性中表达丧失(图5A)。Western blot和流式分选实验进一步证实Tent5c和Tent5d两种基因的表达模式与精子表型一致,Tent5c敲除会导致从附睾中分离的精子头部或DNA物质大量丢失(图5B),而Tent5d 敲除会使得睾丸由于严重的组织结构退化明显变小(图5C)。进一步分析发现Tent5c 敲除产生的生殖细胞数量少于野生型,并且可以导致生殖细胞减数分裂过程受阻,从而导致细胞数量在15周龄前保持稳定(图5D、E)。与Sertoli细胞(睾丸营养细胞)共培养能够显著提高生殖细胞的存活率,尤其是Tent5d敲除细胞(图5F)。Direct RNA测序分析发现敲除对整体poly(A)的长度分布影响较小,而年龄对此的影响更为显著(图5G),同时鉴定得到一些导致polyA显著缩短的mRNA(Tppp2、Insl3、Rnaset2),这些mRNA在Tent5c和Tent5d敲除细胞中表达明显不同,但其编码蛋白表达水平也在不同阶段的精子细胞中均有所减少(图5H~N)。
图5:Tent5c和Tent5d影响精子形成过程
6. TENT5家族poly(A)聚合酶在生殖细胞形成中增强分泌蛋白的表达
对含有胞质polyA延伸因子CPEB1/2 motif的mRNA的poly(A)尾长度分布进行分析,结果显示TENT5的敲除未对这些mRNA的poly(A)尾长度分布产生显著影响(图6A)。GO富集分析显示,参与生殖和发育过程的基因占比最多,其中很大比例可以编码分泌蛋白(图6B),典型分泌蛋白内质网(ER)定位信号肽(SP)的发现证实了这一现象(图6C)。在睾丸和卵巢中,TENT5功能缺失对带有ER定位信号的mRNA的poly(A)尾巴长度的影响,比对其他mRNA的影响更为显著,表明带有ER定位信号的mRNA可能是TENT5的主要作用靶点(图6C)。荧光素酶报告基因实验分析发现,TENT5的敲除会导致编码SP的mRNA poly(A)化速率显著降低,表明在翻译起始时被招募到ER的那些转录本依赖于TENT5蛋白进行多聚腺苷酸化(图6D)。
图6:TENT5家族poly(A)聚合酶在生殖细胞形成中增强分泌蛋白的表达
研究总结
本研究通过Direct RNA测序分析揭示了TENT5家族polyA聚合酶在小鼠生殖细胞形成中的关键作用,发现TENT5B和TENT5C在卵子发生中具有部分冗余功能,而TENT5C和TENT5D则调控精子形成。该研究结果不仅加深了我们对生殖细胞中mRNA调控机制的理解,而且为未来生殖健康领域可能的治疗策略提供了新的分子靶点。
图7:TENT5介导mRNA多聚腺苷酸化调控生殖细胞形成机制
参考文献:
Brouze M, Czarnocka-Cieciura A, Gewartowska O, et al. TENT5-mediated polyadenylation of mRNAs encoding secreted proteins is essential for gametogenesis in mice[J]. Nature Communications, 2024, 15(1): 5331.